Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snap25P60879 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snap25P60879 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snap25P60879 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snap25P60879 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snap25P60879 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snap25P60879 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snap25P60879 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snap25P60879 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap25P60879 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap25P60879 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap25P60879 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms