Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91 ms