Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b6P59708 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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