Protein–RNA interactions for Protein: P58389

Ptpa, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpaP58389 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtpaP58389 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtpaP58389 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtpaP58389 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpaP58389 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpaP58389 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpaP58389 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpaP58389 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpaP58389 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpaP58389 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpaP58389 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpaP58389 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtpaP58389 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtpaP58389 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtpaP58389 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms