Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp25P57080 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp25P57080 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp25P57080 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp25P57080 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp25P57080 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp25P57080 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Usp25P57080 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp25P57080 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp25P57080 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp25P57080 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp25P57080 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp25P57080 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp25P57080 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp25P57080 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp25P57080 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp25P57080 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp25P57080 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp25P57080 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp25P57080 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp25P57080 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp25P57080 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp25P57080 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp25P57080 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp25P57080 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp25P57080 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp25P57080 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp25P57080 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp25P57080 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp25P57080 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp25P57080 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp25P57080 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp25P57080 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms