Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lim2P56563 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lim2P56563 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lim2P56563 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lim2P56563 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lim2P56563 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lim2P56563 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lim2P56563 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lim2P56563 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lim2P56563 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lim2P56563 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lim2P56563 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lim2P56563 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms