Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp5P56399 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp5P56399 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp5P56399 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp5P56399 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp5P56399 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp5P56399 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp5P56399 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp5P56399 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms