Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CdaP56389 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CdaP56389 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CdaP56389 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CdaP56389 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CdaP56389 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CdaP56389 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CdaP56389 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CdaP56389 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CdaP56389 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CdaP56389 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CdaP56389 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CdaP56389 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CdaP56389 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CdaP56389 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CdaP56389 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CdaP56389 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CdaP56389 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CdaP56389 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CdaP56389 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CdaP56389 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CdaP56389 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CdaP56389 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CdaP56389 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CdaP56389 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CdaP56389 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CdaP56389 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CdaP56389 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CdaP56389 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CdaP56389 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CdaP56389 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CdaP56389 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CdaP56389 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CdaP56389 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CdaP56389 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CdaP56389 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CdaP56389 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CdaP56389 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CdaP56389 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CdaP56389 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CdaP56389 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CdaP56389 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CdaP56389 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CdaP56389 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CdaP56389 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CdaP56389 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CdaP56389 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CdaP56389 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CdaP56389 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CdaP56389 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CdaP56389 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CdaP56389 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CdaP56389 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CdaP56389 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CdaP56389 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CdaP56389 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CdaP56389 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CdaP56389 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CdaP56389 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CdaP56389 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CdaP56389 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CdaP56389 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CdaP56389 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CdaP56389 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CdaP56389 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CdaP56389 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CdaP56389 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CdaP56389 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CdaP56389 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CdaP56389 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CdaP56389 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CdaP56389 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CdaP56389 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CdaP56389 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CdaP56389 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CdaP56389 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CdaP56389 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CdaP56389 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CdaP56389 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CdaP56389 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CdaP56389 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CdaP56389 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CdaP56389 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CdaP56389 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CdaP56389 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CdaP56389 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CdaP56389 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CdaP56389 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CdaP56389 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CdaP56389 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CdaP56389 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CdaP56389 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CdaP56389 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CdaP56389 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CdaP56389 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CdaP56389 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CdaP56389 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CdaP56389 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CdaP56389 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CdaP56389 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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