Protein–RNA interactions for Protein: P56203

Ctsw, Cathepsin W, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtswP56203 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtswP56203 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtswP56203 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CtswP56203 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtswP56203 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtswP56203 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtswP56203 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtswP56203 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtswP56203 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtswP56203 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtswP56203 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtswP56203 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtswP56203 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtswP56203 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CtswP56203 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtswP56203 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtswP56203 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtswP56203 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtswP56203 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CtswP56203 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtswP56203 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CtswP56203 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtswP56203 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtswP56203 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtswP56203 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CtswP56203 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtswP56203 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtswP56203 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtswP56203 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtswP56203 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtswP56203 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtswP56203 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtswP56203 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtswP56203 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtswP56203 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtswP56203 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtswP56203 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtswP56203 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtswP56203 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtswP56203 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtswP56203 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtswP56203 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtswP56203 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtswP56203 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtswP56203 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtswP56203 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtswP56203 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CtswP56203 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtswP56203 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtswP56203 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtswP56203 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtswP56203 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtswP56203 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtswP56203 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtswP56203 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtswP56203 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtswP56203 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtswP56203 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtswP56203 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtswP56203 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtswP56203 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtswP56203 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtswP56203 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtswP56203 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtswP56203 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtswP56203 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtswP56203 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtswP56203 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtswP56203 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtswP56203 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtswP56203 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtswP56203 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtswP56203 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtswP56203 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtswP56203 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtswP56203 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CtswP56203 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtswP56203 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtswP56203 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtswP56203 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtswP56203 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtswP56203 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtswP56203 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtswP56203 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtswP56203 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtswP56203 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtswP56203 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtswP56203 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtswP56203 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CtswP56203 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtswP56203 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtswP56203 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtswP56203 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtswP56203 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtswP56203 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtswP56203 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtswP56203 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtswP56203 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtswP56203 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtswP56203 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms