Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp1P56183 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp1P56183 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp1P56183 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp1P56183 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp1P56183 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp1P56183 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp1P56183 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp1P56183 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp1P56183 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp1P56183 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp1P56183 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp1P56183 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp1P56183 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp1P56183 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp1P56183 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp1P56183 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rrp1P56183 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rrp1P56183 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rrp1P56183 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rrp1P56183 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rrp1P56183 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rrp1P56183 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rrp1P56183 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rrp1P56183 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rrp1P56183 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rrp1P56183 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rrp1P56183 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rrp1P56183 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rrp1P56183 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rrp1P56183 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms