Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GemP55041 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GemP55041 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GemP55041 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GemP55041 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GemP55041 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GemP55041 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GemP55041 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GemP55041 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GemP55041 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GemP55041 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GemP55041 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GemP55041 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GemP55041 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GemP55041 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GemP55041 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GemP55041 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GemP55041 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GemP55041 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GemP55041 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GemP55041 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GemP55041 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GemP55041 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GemP55041 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GemP55041 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GemP55041 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GemP55041 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GemP55041 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GemP55041 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GemP55041 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GemP55041 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GemP55041 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GemP55041 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GemP55041 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GemP55041 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GemP55041 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GemP55041 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GemP55041 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GemP55041 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GemP55041 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GemP55041 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GemP55041 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GemP55041 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GemP55041 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GemP55041 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GemP55041 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GemP55041 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GemP55041 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GemP55041 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GemP55041 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GemP55041 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GemP55041 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GemP55041 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GemP55041 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GemP55041 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GemP55041 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GemP55041 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GemP55041 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GemP55041 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GemP55041 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GemP55041 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GemP55041 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GemP55041 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GemP55041 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GemP55041 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GemP55041 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GemP55041 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GemP55041 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GemP55041 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GemP55041 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GemP55041 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GemP55041 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GemP55041 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GemP55041 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GemP55041 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GemP55041 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GemP55041 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GemP55041 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GemP55041 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GemP55041 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GemP55041 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GemP55041 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GemP55041 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GemP55041 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GemP55041 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GemP55041 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GemP55041 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GemP55041 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GemP55041 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GemP55041 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GemP55041 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GemP55041 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GemP55041 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GemP55041 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GemP55041 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GemP55041 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GemP55041 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GemP55041 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GemP55041 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GemP55041 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.1 ms