Protein–RNA interactions for Protein: P54130

Fgf9, Fibroblast growth factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf9P54130 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fgf9P54130 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fgf9P54130 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fgf9P54130 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fgf9P54130 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fgf9P54130 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fgf9P54130 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fgf9P54130 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fgf9P54130 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Fgf9P54130 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fgf9P54130 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Fgf9P54130 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fgf9P54130 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fgf9P54130 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fgf9P54130 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fgf9P54130 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fgf9P54130 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fgf9P54130 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fgf9P54130 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fgf9P54130 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fgf9P54130 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fgf9P54130 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fgf9P54130 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fgf9P54130 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fgf9P54130 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fgf9P54130 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fgf9P54130 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fgf9P54130 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fgf9P54130 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fgf9P54130 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Fgf9P54130 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Fgf9P54130 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Fgf9P54130 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Fgf9P54130 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Fgf9P54130 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Fgf9P54130 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fgf9P54130 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms