Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RabggtbP53612 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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