Protein–RNA interactions for Protein: P52950

Dbx1, Homeobox protein DBX1, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbx1P52950 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms