Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upp1P52624 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upp1P52624 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upp1P52624 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upp1P52624 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upp1P52624 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upp1P52624 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms