Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClgnP52194 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ClgnP52194 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ClgnP52194 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClgnP52194 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClgnP52194 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms