Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms