Protein–RNA interactions for Protein: P50586

Tub, Tubby protein, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TubP50586 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TubP50586 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TubP50586 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TubP50586 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TubP50586 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TubP50586 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TubP50586 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TubP50586 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TubP50586 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TubP50586 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TubP50586 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TubP50586 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TubP50586 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TubP50586 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TubP50586 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TubP50586 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TubP50586 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TubP50586 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TubP50586 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TubP50586 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TubP50586 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TubP50586 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TubP50586 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TubP50586 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TubP50586 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TubP50586 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TubP50586 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TubP50586 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TubP50586 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TubP50586 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TubP50586 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TubP50586 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TubP50586 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TubP50586 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TubP50586 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TubP50586 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TubP50586 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TubP50586 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TubP50586 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TubP50586 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TubP50586 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TubP50586 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TubP50586 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TubP50586 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TubP50586 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TubP50586 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TubP50586 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TubP50586 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TubP50586 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TubP50586 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TubP50586 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TubP50586 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TubP50586 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TubP50586 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TubP50586 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TubP50586 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TubP50586 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TubP50586 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TubP50586 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TubP50586 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TubP50586 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TubP50586 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TubP50586 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TubP50586 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TubP50586 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TubP50586 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TubP50586 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TubP50586 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TubP50586 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TubP50586 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TubP50586 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TubP50586 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TubP50586 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TubP50586 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TubP50586 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TubP50586 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TubP50586 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TubP50586 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TubP50586 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TubP50586 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TubP50586 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TubP50586 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TubP50586 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TubP50586 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TubP50586 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TubP50586 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TubP50586 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TubP50586 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TubP50586 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TubP50586 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TubP50586 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TubP50586 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TubP50586 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TubP50586 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TubP50586 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TubP50586 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TubP50586 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TubP50586 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TubP50586 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TubP50586 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms