Protein–RNA interactions for Protein: P50446

Krt6a, Keratin, type II cytoskeletal 6A, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6aP50446 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt6aP50446 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt6aP50446 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt6aP50446 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt6aP50446 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt6aP50446 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt6aP50446 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt6aP50446 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Krt6aP50446 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt6aP50446 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt6aP50446 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt6aP50446 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt6aP50446 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt6aP50446 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt6aP50446 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt6aP50446 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Krt6aP50446 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt6aP50446 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt6aP50446 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt6aP50446 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt6aP50446 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt6aP50446 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt6aP50446 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt6aP50446 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt6aP50446 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Krt6aP50446 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt6aP50446 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Krt6aP50446 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt6aP50446 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt6aP50446 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt6aP50446 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt6aP50446 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Krt6aP50446 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt6aP50446 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt6aP50446 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt6aP50446 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt6aP50446 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Krt6aP50446 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt6aP50446 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt6aP50446 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt6aP50446 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt6aP50446 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt6aP50446 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt6aP50446 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt6aP50446 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt6aP50446 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt6aP50446 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt6aP50446 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt6aP50446 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt6aP50446 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt6aP50446 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt6aP50446 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt6aP50446 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt6aP50446 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt6aP50446 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt6aP50446 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt6aP50446 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt6aP50446 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Krt6aP50446 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt6aP50446 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt6aP50446 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt6aP50446 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt6aP50446 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt6aP50446 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt6aP50446 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt6aP50446 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt6aP50446 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt6aP50446 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt6aP50446 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt6aP50446 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt6aP50446 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt6aP50446 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt6aP50446 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt6aP50446 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt6aP50446 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt6aP50446 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt6aP50446 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt6aP50446 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt6aP50446 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt6aP50446 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt6aP50446 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Krt6aP50446 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt6aP50446 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt6aP50446 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt6aP50446 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt6aP50446 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt6aP50446 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt6aP50446 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt6aP50446 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Krt6aP50446 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt6aP50446 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Krt6aP50446 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt6aP50446 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt6aP50446 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt6aP50446 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt6aP50446 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt6aP50446 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt6aP50446 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt6aP50446 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt6aP50446 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms