Protein–RNA interactions for Protein: P49429

Hpd, 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpdP49429 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HpdP49429 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HpdP49429 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HpdP49429 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HpdP49429 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HpdP49429 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HpdP49429 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HpdP49429 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HpdP49429 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HpdP49429 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HpdP49429 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HpdP49429 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HpdP49429 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HpdP49429 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HpdP49429 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HpdP49429 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HpdP49429 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HpdP49429 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HpdP49429 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HpdP49429 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HpdP49429 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HpdP49429 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HpdP49429 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HpdP49429 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HpdP49429 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HpdP49429 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HpdP49429 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HpdP49429 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HpdP49429 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HpdP49429 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HpdP49429 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HpdP49429 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HpdP49429 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HpdP49429 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HpdP49429 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HpdP49429 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HpdP49429 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HpdP49429 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HpdP49429 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HpdP49429 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HpdP49429 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HpdP49429 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HpdP49429 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HpdP49429 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HpdP49429 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HpdP49429 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HpdP49429 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HpdP49429 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HpdP49429 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HpdP49429 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HpdP49429 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HpdP49429 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HpdP49429 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HpdP49429 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HpdP49429 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HpdP49429 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HpdP49429 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HpdP49429 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HpdP49429 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HpdP49429 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HpdP49429 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HpdP49429 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HpdP49429 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HpdP49429 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HpdP49429 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HpdP49429 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HpdP49429 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HpdP49429 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HpdP49429 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HpdP49429 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HpdP49429 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HpdP49429 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HpdP49429 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HpdP49429 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HpdP49429 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HpdP49429 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HpdP49429 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HpdP49429 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HpdP49429 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HpdP49429 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HpdP49429 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HpdP49429 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HpdP49429 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HpdP49429 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HpdP49429 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HpdP49429 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HpdP49429 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HpdP49429 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HpdP49429 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HpdP49429 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HpdP49429 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HpdP49429 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HpdP49429 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HpdP49429 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HpdP49429 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HpdP49429 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HpdP49429 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HpdP49429 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HpdP49429 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HpdP49429 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms