Protein–RNA interactions for Protein: P48725

Pcnt, Pericentrin, mousemouse

Predictions only

Length 2,898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcntP48725 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PcntP48725 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcntP48725 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcntP48725 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcntP48725 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcntP48725 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PcntP48725 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcntP48725 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcntP48725 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcntP48725 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcntP48725 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcntP48725 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcntP48725 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcntP48725 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PcntP48725 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcntP48725 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PcntP48725 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcntP48725 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PcntP48725 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcntP48725 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PcntP48725 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcntP48725 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcntP48725 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcntP48725 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcntP48725 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcntP48725 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PcntP48725 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PcntP48725 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PcntP48725 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PcntP48725 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PcntP48725 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PcntP48725 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PcntP48725 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PcntP48725 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PcntP48725 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PcntP48725 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PcntP48725 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PcntP48725 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PcntP48725 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PcntP48725 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PcntP48725 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PcntP48725 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PcntP48725 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PcntP48725 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PcntP48725 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PcntP48725 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PcntP48725 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PcntP48725 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PcntP48725 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PcntP48725 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PcntP48725 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PcntP48725 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PcntP48725 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PcntP48725 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PcntP48725 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PcntP48725 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PcntP48725 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PcntP48725 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PcntP48725 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PcntP48725 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PcntP48725 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PcntP48725 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PcntP48725 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PcntP48725 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PcntP48725 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PcntP48725 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PcntP48725 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PcntP48725 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PcntP48725 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PcntP48725 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PcntP48725 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PcntP48725 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PcntP48725 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PcntP48725 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PcntP48725 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PcntP48725 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PcntP48725 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PcntP48725 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PcntP48725 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PcntP48725 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PcntP48725 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcntP48725 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcntP48725 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcntP48725 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcntP48725 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcntP48725 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PcntP48725 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PcntP48725 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PcntP48725 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PcntP48725 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PcntP48725 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcntP48725 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcntP48725 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcntP48725 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcntP48725 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcntP48725 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcntP48725 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcntP48725 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PcntP48725 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcntP48725 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms