Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfx2P48379 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms