Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl13P47963 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl13P47963 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpl13P47963 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpl13P47963 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpl13P47963 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpl13P47963 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpl13P47963 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpl13P47963 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpl13P47963 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpl13P47963 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpl13P47963 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpl13P47963 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpl13P47963 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpl13P47963 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpl13P47963 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl13P47963 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms