Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrprbP47758 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SrprbP47758 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrprbP47758 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrprbP47758 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrprbP47758 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrprbP47758 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SrprbP47758 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrprbP47758 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrprbP47758 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SrprbP47758 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms