Protein–RNA interactions for Protein: P47708

Rph3a, Rabphilin-3A, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3aP47708 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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