Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms