Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Tnfsf9P41274 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Tnfsf9P41274 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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Tnfsf9P41274 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsf9P41274 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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