Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Mmp9P41245 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mmp9P41245 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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