Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chd1P40201 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd1P40201 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd1P40201 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd1P40201 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chd1P40201 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Chd1P40201 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Chd1P40201 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chd1P40201 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chd1P40201 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms