Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms