Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grin2aP35436 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grin2aP35436 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grin2aP35436 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grin2aP35436 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grin2aP35436 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grin2aP35436 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grin2aP35436 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grin2aP35436 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grin2aP35436 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grin2aP35436 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grin2aP35436 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grin2aP35436 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms