Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab20P35295 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab20P35295 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab20P35295 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab20P35295 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab20P35295 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms