Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms