Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms