Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RxrgP28705 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxrgP28705 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RxrgP28705 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RxrgP28705 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RxrgP28705 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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