Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxraP28700 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxraP28700 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxraP28700 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxraP28700 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxraP28700 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxraP28700 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxraP28700 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxraP28700 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxraP28700 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxraP28700 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxraP28700 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxraP28700 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxraP28700 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxraP28700 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxraP28700 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxraP28700 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxraP28700 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxraP28700 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RxraP28700 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RxraP28700 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxraP28700 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxraP28700 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RxraP28700 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxraP28700 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxraP28700 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxraP28700 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxraP28700 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxraP28700 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxraP28700 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxraP28700 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxraP28700 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxraP28700 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxraP28700 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxraP28700 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxraP28700 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxraP28700 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxraP28700 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxraP28700 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxraP28700 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxraP28700 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxraP28700 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxraP28700 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxraP28700 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RxraP28700 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxraP28700 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RxraP28700 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxraP28700 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxraP28700 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxraP28700 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxraP28700 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxraP28700 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxraP28700 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxraP28700 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxraP28700 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxraP28700 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxraP28700 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxraP28700 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxraP28700 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxraP28700 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxraP28700 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxraP28700 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxraP28700 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxraP28700 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxraP28700 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxraP28700 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxraP28700 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxraP28700 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxraP28700 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxraP28700 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxraP28700 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxraP28700 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxraP28700 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxraP28700 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxraP28700 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RxraP28700 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RxraP28700 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxraP28700 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RxraP28700 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RxraP28700 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxraP28700 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxraP28700 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxraP28700 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxraP28700 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxraP28700 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxraP28700 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxraP28700 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxraP28700 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RxraP28700 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxraP28700 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxraP28700 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxraP28700 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxraP28700 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxraP28700 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxraP28700 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RxraP28700 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxraP28700 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxraP28700 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxraP28700 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxraP28700 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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