Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apex1P28352 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apex1P28352 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apex1P28352 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Apex1P28352 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apex1P28352 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apex1P28352 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apex1P28352 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Apex1P28352 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Apex1P28352 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Apex1P28352 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apex1P28352 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apex1P28352 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apex1P28352 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apex1P28352 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apex1P28352 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apex1P28352 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apex1P28352 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apex1P28352 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apex1P28352 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apex1P28352 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Apex1P28352 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Apex1P28352 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apex1P28352 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apex1P28352 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apex1P28352 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Apex1P28352 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apex1P28352 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apex1P28352 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apex1P28352 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apex1P28352 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apex1P28352 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apex1P28352 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apex1P28352 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apex1P28352 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apex1P28352 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apex1P28352 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apex1P28352 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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