Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav1P27870 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav1P27870 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vav1P27870 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vav1P27870 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vav1P27870 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vav1P27870 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vav1P27870 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms