Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2afxP27661 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
H2afxP27661 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2afxP27661 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2afxP27661 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2afxP27661 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2afxP27661 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2afxP27661 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms