Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CftrP26361 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CftrP26361 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CftrP26361 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CftrP26361 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CftrP26361 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CftrP26361 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CftrP26361 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CftrP26361 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CftrP26361 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CftrP26361 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CftrP26361 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CftrP26361 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CftrP26361 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CftrP26361 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CftrP26361 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CftrP26361 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CftrP26361 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CftrP26361 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CftrP26361 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CftrP26361 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CftrP26361 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CftrP26361 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CftrP26361 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CftrP26361 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CftrP26361 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CftrP26361 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CftrP26361 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CftrP26361 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CftrP26361 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CftrP26361 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CftrP26361 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CftrP26361 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CftrP26361 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CftrP26361 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CftrP26361 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CftrP26361 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CftrP26361 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CftrP26361 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CftrP26361 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CftrP26361 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CftrP26361 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CftrP26361 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CftrP26361 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CftrP26361 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CftrP26361 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CftrP26361 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CftrP26361 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CftrP26361 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CftrP26361 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CftrP26361 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CftrP26361 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CftrP26361 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CftrP26361 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CftrP26361 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CftrP26361 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CftrP26361 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CftrP26361 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CftrP26361 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CftrP26361 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CftrP26361 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CftrP26361 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CftrP26361 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CftrP26361 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CftrP26361 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CftrP26361 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CftrP26361 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CftrP26361 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CftrP26361 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CftrP26361 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CftrP26361 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CftrP26361 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CftrP26361 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CftrP26361 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CftrP26361 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CftrP26361 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CftrP26361 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CftrP26361 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CftrP26361 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CftrP26361 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CftrP26361 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CftrP26361 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CftrP26361 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CftrP26361 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CftrP26361 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CftrP26361 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CftrP26361 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CftrP26361 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CftrP26361 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CftrP26361 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CftrP26361 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CftrP26361 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CftrP26361 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CftrP26361 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CftrP26361 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CftrP26361 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CftrP26361 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CftrP26361 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CftrP26361 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CftrP26361 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms