Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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