Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd12P23812 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms