Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms