Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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