Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ms4a2P20490 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms