Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csn1s1P19228 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csn1s1P19228 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csn1s1P19228 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csn1s1P19228 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csn1s1P19228 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csn1s1P19228 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csn1s1P19228 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csn1s1P19228 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csn1s1P19228 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csn1s1P19228 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csn1s1P19228 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csn1s1P19228 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csn1s1P19228 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csn1s1P19228 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csn1s1P19228 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csn1s1P19228 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csn1s1P19228 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csn1s1P19228 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csn1s1P19228 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csn1s1P19228 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csn1s1P19228 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Csn1s1P19228 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csn1s1P19228 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csn1s1P19228 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csn1s1P19228 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csn1s1P19228 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csn1s1P19228 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csn1s1P19228 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csn1s1P19228 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Csn1s1P19228 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csn1s1P19228 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csn1s1P19228 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csn1s1P19228 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csn1s1P19228 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csn1s1P19228 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csn1s1P19228 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csn1s1P19228 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csn1s1P19228 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csn1s1P19228 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csn1s1P19228 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csn1s1P19228 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csn1s1P19228 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csn1s1P19228 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csn1s1P19228 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csn1s1P19228 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csn1s1P19228 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Csn1s1P19228 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csn1s1P19228 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Csn1s1P19228 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csn1s1P19228 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csn1s1P19228 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Csn1s1P19228 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csn1s1P19228 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Csn1s1P19228 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csn1s1P19228 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csn1s1P19228 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csn1s1P19228 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csn1s1P19228 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csn1s1P19228 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csn1s1P19228 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms