Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnnc1P19123 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms