Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms