Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd44P15379 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd44P15379 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd44P15379 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd44P15379 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd44P15379 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd44P15379 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd44P15379 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd44P15379 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd44P15379 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms