Protein–RNA interactions for Protein: P13516

Scd1, Acyl-CoA desaturase 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd1P13516 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scd1P13516 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Scd1P13516 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scd1P13516 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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Scd1P13516 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scd1P13516 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms